DNA鉴定-Y染色体特异STR基因座在法医鉴定中的应用
1、男女混合斑检验
性犯罪案件中，犯罪的精液与受害者的细胞成分常呈现混合斑迹。虽然可以利用差异裂解的办法使精子细胞与女性成分分离，但有时仍会发生在精子DNA中残留有女性物质。还有部分案件材料是男女混合血液、唾液时，不可能用差异裂解法分离开男女性DNA,而应用Y染色体特异STR基因座分析，可以很简单地确定男性的单倍体型。Y染色体特异的STR基因座多态性分析和常染色体STR分析不同，即使是较大量的女性DNA成分也不抑制Y特异的STR等位基因的扩增。Y染色体特异STR基因座的检验位强奸和性犯罪案件中混有被害者女性DNA的精斑或其他男性血液/体液与女性血液/体液的混合斑物证检验提供了分析方法，获得犯罪的特征性遗传信息。
2、父子关系鉴定
Y-STR多态性是父系遗传，因此在父权鉴定中具有实际意义。Y-STR在父子关系鉴定中的平均排除概率和个人识别概率是相同的。因此，多Y-STR座位连锁的多态性与常染色体基因座比较，具有较高的排除能力。Y-STR的父系遗传特征在被指控的父亲已不在的亲权关系鉴定中，可能提供有用的相关信息，例如被指控的父亲已经去逝，可以考虑采用该家庭中同一父系的男性亲属血样代替他做实验，提供关于他的Y染色体STR基因座全部信息。
3、不同男性个体混合物（斑）分析
如精液-精液、血液-血液、血液-唾液等不同男性个体的混合物，提取的DNA显然是多个个体混合材料，不同个体DNA无法区分，此时检验Y染色体特异遗传标记可能有所帮助。例如强奸案件中的精液斑，检验Y染色体特异的STR基因座常常可以确定精液供者的人数。此时虽然不能从混合物分析中直接推断出各个强奸犯的单倍体，但可以对混合物和嫌疑人的单倍型分析直接比对，可望获得犯罪的线索。
在个体识别中，当采用多个Y染色体特异STR基因座进行检验时，联合识别力可能达到很高。但Y-STR基因座等位基因是单倍体，各基因座的遗传是连锁的；同一父系的男性，具有同样的单倍体，因此Y-STR多态性作个人识别有一定局限性。有实际意义的是Y-STR单倍体不一致时，可以做出否定的结论。
